Desde varias décadas atrás, el  crecimiento de la Universidad trascendió los límites de la ciudad capital, abriéndose institutos y carreras profesionales en Yacuiba, Villa Montes, Bermejo, Entre Ríos, El Palmar y Caraparí atendiendo las necesidades de  formación técnica y superior  en el Departamento, constituyéndose en la institución educativa más importante de Tarija.

Aparece en el escenario Nacional como Universidad propositiva cuando encara un proceso inédito de reforma de la educación superior;  declarada  Universidad Piloto para el Cambio y Transformación de la Educación Superior en Bolivia y América Latina, por el IESALC/UNESCO (1998).

Proceso de cambio y transformación

Antecedentes sobre la gestión del proceso   de cambio y   transformación de la UAJMS:

Gestión del Lic. Carlos Cabrera Iñiguez - Rector

1996:   Se elabora  el 1er. Diagnóstico Institucional

1997:     Se formula el  1er. Plan Quinquenal de Desarrollo Universitario, 1997-2001.

1998:     Se formula y presenta al IESALC/UNESCO el proyecto de cambio y Transformación de la UAJMS

1998      Se declara a la UAJMS Universidad Piloto para el Cambio y Transformación de la Educación Superior en Bolivia, por el IESALC/UNESCO

1999:     Autoevaluación por Programas   e       Institucional

1999:  Evaluación Externa por Pares Académicos del IESALC.

2000:     Se formula el Plan Piloto de Acción IESALC/UNESCO, para el Cambio y Transformación de la Educación Superior en la UAJMS, 2000 – 2004

Gestión del Lic. Eduardo Cortez Baldiviezo - Rector

2004-2007: Se desarrolla, ejecuta y evalúa el Plan Piloto de Acción

2004: Ante la falta de recursos económicos para llevar adelante el proceso de transformación  se consigue recursos económicos provenientes de las regalías  Hidrocarburíferas según resolución # 129/2004 emanada del Honorable Consejo departamental que valora Y  destaca la proyección de la Universidad Tarijeña en su afán de mejorar la educación superior.

2007: Se lleva adelante una política de estabilidad laboral y escalafón docente, como  paso fundamental en el proceso modernizador,  aumentando el número de docentes  titulares y a tiempo completo.

2004 – 2007: Las  carreras son rediseñadas curricularmente bajo los siguientes  postulados:

1. Formación integral del estudiante (alta formación  profesional y ciudadana, con principios y valores)
2. Mejoramiento de la pertinencia y calidad del Currículo Profesional ( Perfil, Plan, Programa)
3. Enfoque pedagógico centrado en el aprendizaje
4. Creación de espacios integradores que propicie la interdisciplinariedad
5. Materias troncales, optativas y electivas
6. Incorporación del sistema de créditos (inicial)
7. Reducción de la carga horaria
8. Nuevo enfoque de evaluación de  los estudiantes
9. Graduación directa
10. Reducción del grupo de clase
11. Incorporación creciente de las TIC
12. Incorporación de un idioma extranjero
13. Sistema  semestral mixto, con administración anualizada

2004 – 2007: Se fortalece las Alianzas Estratégicas.